Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Hoxc5P32043 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Hoxc5P32043 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms