Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxc11P31313 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc11P31313 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms