Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxrgP28705 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxrgP28705 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RxrgP28705 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxrgP28705 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RxrgP28705 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxrgP28705 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxrgP28705 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxrgP28705 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxrgP28705 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
RxrgP28705 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
RxrgP28705 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms