Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Hoxd9P28357 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Hoxd9P28357 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms