Protein–RNA interactions for Protein: P28310

Defa3, Alpha-defensin 3, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa3P28310 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa3P28310 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa3P28310 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa3P28310 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa3P28310 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Defa3P28310 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa3P28310 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa3P28310 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa3P28310 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Defa3P28310 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms