Protein–RNA interactions for Protein: P28229

Gjc1, Gap junction gamma-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjc1P28229 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gjc1P28229 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gjc1P28229 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms