Protein–RNA interactions for Protein: P28078

H2-DMa, Class II histocompatibility antigen, M alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-DMaP28078 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-DMaP28078 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-DMaP28078 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms