Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pde6aP27664 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pde6aP27664 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pde6aP27664 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
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