Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd40lgP27548 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cd40lgP27548 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms