Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gabra3P26049 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gabra3P26049 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms