Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RdxP26043 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RdxP26043 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RdxP26043 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RdxP26043 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RdxP26043 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RdxP26043 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RdxP26043 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RdxP26043 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RdxP26043 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RdxP26043 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RdxP26043 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RdxP26043 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RdxP26043 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RdxP26043 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RdxP26043 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RdxP26043 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RdxP26043 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RdxP26043 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RdxP26043 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RdxP26043 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RdxP26043 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RdxP26043 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RdxP26043 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RdxP26043 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RdxP26043 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RdxP26043 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RdxP26043 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RdxP26043 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RdxP26043 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RdxP26043 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RdxP26043 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RdxP26043 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RdxP26043 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RdxP26043 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RdxP26043 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RdxP26043 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RdxP26043 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RdxP26043 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RdxP26043 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RdxP26043 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RdxP26043 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RdxP26043 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RdxP26043 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RdxP26043 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RdxP26043 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RdxP26043 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RdxP26043 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
RdxP26043 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RdxP26043 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RdxP26043 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RdxP26043 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RdxP26043 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RdxP26043 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RdxP26043 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RdxP26043 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RdxP26043 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RdxP26043 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RdxP26043 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RdxP26043 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RdxP26043 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RdxP26043 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RdxP26043 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RdxP26043 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RdxP26043 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RdxP26043 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RdxP26043 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RdxP26043 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RdxP26043 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RdxP26043 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RdxP26043 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RdxP26043 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RdxP26043 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RdxP26043 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RdxP26043 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RdxP26043 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RdxP26043 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RdxP26043 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RdxP26043 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RdxP26043 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RdxP26043 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RdxP26043 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RdxP26043 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RdxP26043 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RdxP26043 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RdxP26043 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RdxP26043 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RdxP26043 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RdxP26043 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RdxP26043 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RdxP26043 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
RdxP26043 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RdxP26043 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
RdxP26043 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RdxP26043 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RdxP26043 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RdxP26043 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RdxP26043 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RdxP26043 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
RdxP26043 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms