Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
NdnP25233 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdnP25233 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NdnP25233 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdnP25233 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NdnP25233 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdnP25233 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdnP25233 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdnP25233 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NdnP25233 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
NdnP25233 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdnP25233 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NdnP25233 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdnP25233 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NdnP25233 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdnP25233 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NdnP25233 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdnP25233 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdnP25233 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NdnP25233 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NdnP25233 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NdnP25233 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NdnP25233 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NdnP25233 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NdnP25233 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NdnP25233 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NdnP25233 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
NdnP25233 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NdnP25233 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NdnP25233 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NdnP25233 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NdnP25233 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NdnP25233 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NdnP25233 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NdnP25233 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NdnP25233 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NdnP25233 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NdnP25233 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NdnP25233 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NdnP25233 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NdnP25233 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NdnP25233 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NdnP25233 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NdnP25233 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NdnP25233 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NdnP25233 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NdnP25233 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NdnP25233 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NdnP25233 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NdnP25233 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NdnP25233 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NdnP25233 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NdnP25233 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NdnP25233 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NdnP25233 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NdnP25233 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NdnP25233 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms