Protein–RNA interactions for Protein: P23708

Nfya, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfyaP23708 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfyaP23708 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
NfyaP23708 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NfyaP23708 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfyaP23708 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NfyaP23708 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms