Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja1P23242 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja1P23242 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja1P23242 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja1P23242 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gja1P23242 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gja1P23242 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gja1P23242 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja1P23242 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gja1P23242 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms