Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Tnnc2P20801 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tnnc2P20801 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms