Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PrkcaP20444 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PrkcaP20444 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms