Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VimP20152 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VimP20152 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VimP20152 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VimP20152 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VimP20152 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VimP20152 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VimP20152 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VimP20152 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VimP20152 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VimP20152 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VimP20152 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VimP20152 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VimP20152 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VimP20152 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VimP20152 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VimP20152 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VimP20152 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VimP20152 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VimP20152 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VimP20152 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VimP20152 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VimP20152 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VimP20152 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VimP20152 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VimP20152 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VimP20152 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VimP20152 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VimP20152 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VimP20152 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VimP20152 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VimP20152 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VimP20152 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VimP20152 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VimP20152 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VimP20152 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VimP20152 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VimP20152 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VimP20152 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VimP20152 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VimP20152 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VimP20152 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
VimP20152 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VimP20152 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VimP20152 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VimP20152 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VimP20152 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VimP20152 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VimP20152 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VimP20152 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VimP20152 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VimP20152 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VimP20152 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VimP20152 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VimP20152 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VimP20152 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VimP20152 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VimP20152 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VimP20152 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VimP20152 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VimP20152 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VimP20152 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VimP20152 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VimP20152 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VimP20152 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VimP20152 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VimP20152 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VimP20152 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
VimP20152 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VimP20152 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VimP20152 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VimP20152 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VimP20152 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VimP20152 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VimP20152 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VimP20152 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VimP20152 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VimP20152 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VimP20152 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VimP20152 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VimP20152 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
VimP20152 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VimP20152 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VimP20152 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VimP20152 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VimP20152 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VimP20152 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VimP20152 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms