Protein–RNA interactions for Protein: P20040

H-2 class II histocompatibility antigen, E-Q beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P20040 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P20040 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P20040 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P20040 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P20040 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P20040 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P20040 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P20040 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P20040 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P20040 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P20040 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P20040 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P20040 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P20040 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P20040 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
P20040 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
P20040 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
P20040 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P20040 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P20040 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P20040 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
P20040 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P20040 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P20040 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P20040 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P20040 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
P20040 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
P20040 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
P20040 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
P20040 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P20040 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P20040 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P20040 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P20040 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P20040 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P20040 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
P20040 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P20040 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P20040 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
P20040 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
P20040 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P20040 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P20040 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P20040 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P20040 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P20040 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P20040 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P20040 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P20040 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
P20040 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P20040 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P20040 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
P20040 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P20040 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P20040 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
P20040 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
P20040 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P20040 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P20040 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P20040 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P20040 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P20040 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P20040 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P20040 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P20040 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P20040 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P20040 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
P20040 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P20040 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
P20040 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P20040 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
P20040 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P20040 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P20040 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P20040 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P20040 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P20040 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P20040 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms