Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Rpl13aP19253 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Rpl13aP19253 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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