Protein–RNA interactions for Protein: P18911

Rarg, Retinoic acid receptor gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RargP18911 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RargP18911 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RargP18911 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RargP18911 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
RargP18911 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
RargP18911 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RargP18911 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RargP18911 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RargP18911 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RargP18911 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
RargP18911 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
RargP18911 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
RargP18911 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RargP18911 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RargP18911 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RargP18911 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
RargP18911 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RargP18911 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
RargP18911 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RargP18911 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RargP18911 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
RargP18911 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RargP18911 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
RargP18911 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RargP18911 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RargP18911 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RargP18911 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RargP18911 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RargP18911 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RargP18911 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RargP18911 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
RargP18911 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RargP18911 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RargP18911 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
RargP18911 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
RargP18911 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RargP18911 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RargP18911 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RargP18911 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RargP18911 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RargP18911 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RargP18911 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RargP18911 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RargP18911 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RargP18911 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RargP18911 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
RargP18911 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RargP18911 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
RargP18911 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
RargP18911 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RargP18911 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RargP18911 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RargP18911 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RargP18911 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RargP18911 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RargP18911 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RargP18911 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RargP18911 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RargP18911 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
RargP18911 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
RargP18911 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RargP18911 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RargP18911 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RargP18911 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RargP18911 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RargP18911 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
RargP18911 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RargP18911 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RargP18911 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
RargP18911 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RargP18911 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RargP18911 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RargP18911 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RargP18911 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RargP18911 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
RargP18911 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RargP18911 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RargP18911 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RargP18911 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RargP18911 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RargP18911 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RargP18911 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
RargP18911 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
RargP18911 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RargP18911 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RargP18911 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RargP18911 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
RargP18911 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RargP18911 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RargP18911 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RargP18911 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RargP18911 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RargP18911 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
RargP18911 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RargP18911 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RargP18911 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
RargP18911 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RargP18911 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RargP18911 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
RargP18911 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms