Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18528 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18528 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P18528 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18528 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18528 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P18528 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18528 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P18528 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18528 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P18528 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18528 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18528 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P18528 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18528 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P18528 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18528 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18528 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18528 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18528 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
P18528 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18528 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P18528 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
P18528 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P18528 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18528 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18528 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18528 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18528 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18528 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18528 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18528 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P18528 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18528 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18528 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P18528 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18528 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18528 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18528 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18528 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18528 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18528 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P18528 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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P18528 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18528 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P18528 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18528 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P18528 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P18528 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18528 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P18528 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18528 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18528 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18528 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18528 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P18528 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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P18528 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
P18528 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18528 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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P18528 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18528 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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P18528 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P18528 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P18528 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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P18528 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P18528 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
P18528 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18528 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18528 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18528 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18528 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18528 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18528 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18528 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18528 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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P18528 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18528 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18528 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18528 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18528 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18528 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
P18528 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
P18528 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18528 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
P18528 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
P18528 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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