Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Cxcl9P18340 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cxcl9P18340 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms