Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxb1P17919 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxb1P17919 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms