Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ptbp1P17225 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ptbp1P17225 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms