Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcna1P16388 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcna1P16388 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kcna1P16388 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kcna1P16388 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kcna1P16388 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Kcna1P16388 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms