Protein–RNA interactions for Protein: P15975

Usp53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, mousemouse

Predictions only

Length 1,069 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp53P15975 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp53P15975 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp53P15975 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp53P15975 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Usp53P15975 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp53P15975 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Usp53P15975 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp53P15975 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp53P15975 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Usp53P15975 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp53P15975 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp53P15975 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp53P15975 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Usp53P15975 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Usp53P15975 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms