Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Q9P14431 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-Q9P14431 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-Q9P14431 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Q9P14431 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Q9P14431 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Q9P14431 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Q9P14431 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Q9P14431 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Q9P14431 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Q9P14431 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Q9P14431 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Q9P14431 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms