Protein–RNA interactions for Protein: P14115

Rpl27a, 60S ribosomal protein L27a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27aP14115 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rpl27aP14115 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl27aP14115 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl27aP14115 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl27aP14115 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl27aP14115 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl27aP14115 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rpl27aP14115 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl27aP14115 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl27aP14115 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rpl27aP14115 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms