Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Vpreb1P13372 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Vpreb1P13372 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms