Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P10404 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P10404 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P10404 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P10404 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P10404 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P10404 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P10404 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P10404 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P10404 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P10404 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P10404 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P10404 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P10404 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P10404 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P10404 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P10404 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P10404 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P10404 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P10404 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P10404 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P10404 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P10404 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P10404 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P10404 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P10404 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P10404 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P10404 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P10404 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P10404 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P10404 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P10404 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P10404 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P10404 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P10404 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P10404 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P10404 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P10404 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P10404 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P10404 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
P10404 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P10404 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P10404 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P10404 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P10404 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P10404 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P10404 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P10404 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P10404 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P10404 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P10404 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P10404 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P10404 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P10404 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P10404 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P10404 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P10404 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P10404 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P10404 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P10404 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P10404 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P10404 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P10404 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P10404 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P10404 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P10404 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P10404 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P10404 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P10404 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P10404 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P10404 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P10404 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P10404 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P10404 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P10404 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P10404 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P10404 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P10404 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P10404 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P10404 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P10404 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P10404 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P10404 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P10404 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P10404 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P10404 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P10404 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P10404 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P10404 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P10404 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P10404 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P10404 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms