Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Hoxb4P10284 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Hoxb4P10284 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms