Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccl2P10148 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl2P10148 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms