Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calm3P0DP28 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calm3P0DP28 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calm3P0DP28 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Calm3P0DP28 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calm3P0DP28 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calm3P0DP28 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calm3P0DP28 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calm3P0DP28 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calm3P0DP28 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Calm3P0DP28 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calm3P0DP28 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calm3P0DP28 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Calm3P0DP28 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Calm3P0DP28 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Calm3P0DP28 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calm3P0DP28 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calm3P0DP28 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calm3P0DP28 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calm3P0DP28 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Calm3P0DP28 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calm3P0DP28 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calm3P0DP28 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calm3P0DP28 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms