Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ifna9P09235 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ifna9P09235 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms