Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxa1P09022 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxa1P09022 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms