Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Hoxa5P09021 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hoxa5P09021 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms