Protein–RNA interactions for Protein: P07351

Ifna4, Interferon alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna4P07351 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna4P07351 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ifna4P07351 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms