Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifna5P07349 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna5P07349 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms