Protein–RNA interactions for Protein: P06800

Ptprc, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, mousemouse

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Length 1,291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprcP06800 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprcP06800 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprcP06800 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprcP06800 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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PtprcP06800 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
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PtprcP06800 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprcP06800 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PtprcP06800 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PtprcP06800 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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PtprcP06800 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PtprcP06800 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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PtprcP06800 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PtprcP06800 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
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PtprcP06800 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PtprcP06800 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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PtprcP06800 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
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PtprcP06800 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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PtprcP06800 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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PtprcP06800 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
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PtprcP06800 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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PtprcP06800 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
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PtprcP06800 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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PtprcP06800 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprcP06800 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprcP06800 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprcP06800 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
PtprcP06800 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms