Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxa4P06798 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Hoxa4P06798 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms