Protein–RNA interactions for Protein: P05366

Saa1, Serum amyloid A-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa1P05366 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Saa1P05366 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa1P05366 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa1P05366 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa1P05366 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa1P05366 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Saa1P05366 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Saa1P05366 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Saa1P05366 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Saa1P05366 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms