Protein–RNA interactions for Protein: P05143

Prp2, Proline-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prp2P05143 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prp2P05143 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prp2P05143 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prp2P05143 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prp2P05143 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prp2P05143 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prp2P05143 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prp2P05143 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms