Protein–RNA interactions for Protein: P04444

Hbb-bh1, Hemoglobin subunit beta-H1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh1P04444 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hbb-bh1P04444 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hbb-bh1P04444 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms