Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
H2-Eb1P04230 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
H2-Eb1P04230 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms