Protein–RNA interactions for Protein: P04219

Putative uncharacterized Ig-region protein, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04219 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04219 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04219 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04219 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04219 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04219 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04219 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04219 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04219 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04219 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
P04219 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04219 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04219 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04219 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04219 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04219 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04219 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04219 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04219 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04219 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04219 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
P04219 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04219 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04219 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04219 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04219 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04219 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04219 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
P04219 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04219 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04219 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04219 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04219 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
P04219 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04219 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04219 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04219 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04219 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04219 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04219 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04219 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04219 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04219 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04219 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04219 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04219 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04219 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04219 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04219 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04219 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04219 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
P04219 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04219 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04219 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04219 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04219 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04219 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04219 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04219 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04219 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04219 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04219 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04219 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04219 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04219 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04219 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P04219 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04219 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04219 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
P04219 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04219 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04219 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04219 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04219 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04219 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04219 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04219 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04219 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04219 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04219 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04219 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04219 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04219 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04219 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04219 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P04219 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04219 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04219 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04219 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04219 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04219 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04219 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04219 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04219 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04219 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04219 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04219 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04219 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04219 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P04219 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms