Protein–RNA interactions for Protein: P01798

Ig heavy chain V-III region E109, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01798 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01798 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01798 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01798 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01798 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01798 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01798 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01798 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01798 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01798 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01798 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01798 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01798 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01798 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01798 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01798 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01798 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01798 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01798 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P01798 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01798 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01798 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01798 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01798 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01798 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01798 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01798 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01798 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01798 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01798 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01798 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01798 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01798 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01798 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01798 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01798 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01798 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01798 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01798 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01798 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01798 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01798 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01798 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01798 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01798 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01798 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01798 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01798 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01798 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01798 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01798 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01798 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01798 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01798 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01798 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01798 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01798 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01798 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01798 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01798 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01798 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01798 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01798 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01798 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01798 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01798 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01798 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01798 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01798 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01798 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01798 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01798 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01798 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01798 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01798 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01798 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01798 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01798 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01798 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01798 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01798 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01798 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01798 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01798 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01798 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01798 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01798 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01798 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01798 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01798 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01798 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01798 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01798 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P01798 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01798 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P01798 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01798 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01798 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01798 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01798 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms