Protein–RNA interactions for Protein: P01746

Ig heavy chain V region 93G7, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01746 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01746 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01746 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01746 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01746 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01746 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01746 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01746 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01746 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01746 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01746 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01746 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01746 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01746 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P01746 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01746 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01746 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P01746 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01746 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01746 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01746 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01746 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01746 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01746 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01746 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01746 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01746 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01746 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01746 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01746 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01746 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01746 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01746 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P01746 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01746 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01746 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01746 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01746 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01746 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01746 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01746 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01746 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01746 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01746 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01746 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01746 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01746 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01746 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01746 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01746 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01746 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01746 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01746 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01746 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P01746 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01746 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01746 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01746 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01746 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01746 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01746 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01746 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01746 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01746 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01746 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01746 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01746 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01746 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01746 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01746 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01746 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01746 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01746 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01746 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01746 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01746 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01746 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01746 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01746 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01746 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms