Protein–RNA interactions for Protein: P01724

Ig lambda-1 chain V regions MOPC 104E/RPC20/J558/S104, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01724 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01724 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01724 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01724 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01724 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01724 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01724 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01724 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01724 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01724 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01724 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01724 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01724 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01724 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01724 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01724 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01724 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01724 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01724 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01724 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01724 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01724 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01724 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01724 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01724 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01724 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01724 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01724 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01724 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01724 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01724 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01724 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01724 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01724 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01724 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01724 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01724 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01724 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01724 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01724 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01724 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01724 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01724 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01724 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01724 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P01724 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01724 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01724 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01724 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01724 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01724 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01724 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01724 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01724 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01724 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01724 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01724 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01724 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01724 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01724 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P01724 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01724 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01724 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01724 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01724 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
P01724 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01724 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01724 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01724 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01724 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01724 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01724 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01724 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P01724 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01724 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
P01724 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01724 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01724 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01724 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01724 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01724 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P01724 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01724 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01724 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01724 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01724 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01724 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P01724 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01724 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01724 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01724 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01724 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01724 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01724 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01724 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01724 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01724 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01724 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01724 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P01724 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms