Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01665 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01665 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01665 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01665 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01665 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01665 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01665 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01665 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01665 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01665 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01665 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01665 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01665 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01665 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01665 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01665 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01665 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01665 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01665 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01665 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01665 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01665 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01665 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01665 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01665 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01665 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01665 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01665 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01665 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01665 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01665 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01665 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01665 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01665 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01665 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01665 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01665 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01665 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01665 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P01665 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01665 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01665 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01665 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01665 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01665 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01665 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01665 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01665 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01665 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01665 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01665 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01665 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01665 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01665 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01665 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01665 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01665 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01665 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01665 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01665 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01665 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01665 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01665 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01665 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01665 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P01665 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01665 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01665 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01665 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01665 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P01665 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P01665 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01665 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01665 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01665 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01665 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01665 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01665 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
P01665 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P01665 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms