Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01658 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01658 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01658 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01658 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01658 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01658 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01658 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01658 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01658 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01658 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01658 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01658 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01658 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01658 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01658 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01658 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01658 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01658 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01658 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01658 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01658 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01658 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01658 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01658 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01658 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01658 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01658 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01658 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01658 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01658 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01658 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01658 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01658 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01658 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P01658 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01658 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01658 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01658 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01658 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01658 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P01658 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01658 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01658 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01658 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01658 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01658 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01658 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01658 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01658 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01658 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01658 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01658 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01658 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01658 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01658 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01658 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01658 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P01658 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01658 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01658 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01658 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01658 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01658 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01658 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01658 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01658 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01658 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01658 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
P01658 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01658 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01658 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01658 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01658 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P01658 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01658 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01658 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01658 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01658 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01658 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01658 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01658 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P01658 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01658 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01658 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01658 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01658 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01658 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01658 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01658 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01658 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01658 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P01658 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P01658 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms